reproducibilidad

Reproducibilidad y validación

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La reproducibilidad de las investigaciones publicadas ha surgido como un tema urgente a resolver en la comunidad científica. Desde organismos de financiación hasta investigadores, fabricantes y editores, es fundamental que todos estos grupos se alineen para garantizar que la investigación se realice con rigor y que sea reproducible.

 

HISTORIA

En 2012, un estudio histórico realizado por Glenn Begley y su equipo llegó a la conclusión de que la mayoría de los estudios sobre el cáncer no eran reproducibles: 47 de los 53 hallazgos publicados no podían ser replicados (Nature 483, 531-533; 2012) Las implicaciones para la investigación biomédica son potencialmente asombrosas considerando los miles de millones gastados cada año en estos estudios. Se ha sugerido que  28.000 millones de dólares se desperdician en investigación pre-clínica irreproducible cada año (Freedman LP, et al PLoS Biology 13: e1002165). Aunque en este fenómeno están implicados muchos factores, sin duda los reactivos (en particular los anticuerpos utilizados en una amplia variedad de aplicaciones) han estado en el centro de esta discusión.

Para tratar de poner solución a este reto, en 2013 se crea el Instituto Global de Estándares Biológicos (GBSI), cuyo objetivo es promover el uso de las mejores prácticas y estándares para mejorar la calidad de la investigación en Biociencias.

En 2016, bajo la dirección de este instituto, los principales interesados de diferentes sectores como academia, productores de anticuerpos, farmacéuticos, financiadores y editores de revistas se reunieron en Asilomar con el fin de discutir posibles soluciones para la validación de anticuerpos. El programa dio lugar a grupos de trabajo que actualmente se encuentran trabajando en el desarrollo de estándares de validación.

PASOS PARA MEJORAR LA REPRODUCIBILIDAD

Los investigadores son fundamentales para mantener la reproducibilidad de la investigación. Estos son algunos pasos que se pueden tomar:

1. Entender

  • Cuando considere la adquisición de anticuerpos comerciales, confirme los métodos de validación y control de calidad. ¿Se prueba cada lote? ¿A qué test se someten? Pida los datos si es necesario.
  • Debería averiguar las siguientes cuestiones con respecto al fabricante de anticuerpos:
    • ¿Es conocido y respetado en la industria de la investigación? Pregunte a los colegas que puedan estar familiarizados. El Informe de mercado sobre anticuerpos de Biocompare es un buen recurso.
    • ¿los reactivos que produce, tienen garantía?
    • ¿Está sujeto a un sistema de gestión de calidad definido? Busque la certificación ISO para asegurar que cumpla con las normas internacionales.
  • ¿Existen publicaciones con el anticuerpo? ¿Ha sido utilizado por algún colega? Busque opiniones independientes de terceros como las de biocompare.com o selectscience.com
  • Póngase en contacto con el soporte técnico antes de comprar si tiene alguna pregunta.
  • Si no está familiarizado con una técnica, reciba formación de un experto cualificado antes de empezar.

2. Validar

  • Al comenzar con un nuevo reactivo, verifique que es el producto más apropiado para su aplicación. La mayoría de los anticuerpos no funcionan en todas las aplicaciones.
  • Independientemente de la validación del fabricante, confirme que el reactivo funciona para su aplicación. Algunas ideas son:
    • Comparar anticuerpos de múltiples fabricantes.
    • Confirmar especificidad por métodos independientes, por ejemplo, utilizar ELISA para confirmar que un anticuerpo anti-IL-2 de citometría de flujo está reconociendo correctamente IL-2.
    • Utilizar siempre controles positivos y negativos, así como controles de isotipo para la citometría de flujo. Además, considere validar con líneas celulares positivas y negativas donde se esperaría que el objetivo se expresara o no se expresara.
    • Realizar titulaciones del anticuerpo para verificar que la unión es específica de la dosis.
    • Utilizar líneas célulares knockout o knockdown para confirmar la especificidad.

3. Documentar

  • Cuando nuevos productos entren en el laboratorio, registre el fabricante, los números de catálogo y los números de lote.
  • Anotar siempre diluciones o concentraciones de los reactivos utilizados en los ensayos.
  • Al publicar, indicar siempre el fabricante y los números de catálogo de los productos utilizados.
  • Presentar datos suplementarios siempre que sea posible.

Taper distribuye los reactivos de la empresa BioLegand que patrocina y colabora con el Instituto Global de Estándares Biológicos (GBSI) en la fijación de estándares de anticuerpos. Puede verificar sus sistemas de validación y control de calidad pinchando en el menú: Antibody Validation and Quality Control.

 

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